法律分析：1.与售车的4S店联系(或与厂家直接联系)办理；2.由个人写出申请，说明情况(最好有或派出所的报案证明)；3.提供购车复印件、购车人身份证明复印件、合格证复印件；4.填写《合格证补发申请单》并注明补办合格证的所有信息(车型、车身号、发动机号、车身颜色等)，盖上售车的4S店章，连同以上材料寄回厂家；5.厂家在确认后，会补发一张新的合格证。 合格证拿到后，注意核对车架号、发动机号是否与一致。特别注意的是：合格证号可能会不一样，如果不同则需要重新开据销售。如果已缴纳车辆购置税，则需要办理变更手续。
法律依据：《中华人民共和国道路交通安全法实施条例》 第十一条 机动车登记证书、号牌、行驶证丢失或者损毁，机动车所有人申请补发的，应当向机关交通管理部门提交本人身份证明和申请材料。机关交通管理部门经与机动车登记档案核实后，在收到申请之日起15日内补发。